اولویت های پژوهشی مرکز به شرح زیر می باشد:
1. تب و تشنج کودکان
2. اپی لپسی کودکان
3. آسم کودکان
4. دیابت و کتواسیدوز دیابتی کودکان
5. ایکتر نوزادیراهنمای بالینی در حال تدوین* اپی لپسی کودکان